黃鼠冠狀病毒HKU24

黃鼠冠狀病毒HKU24
病毒分類
（未分級）：	病毒 Virus
域：	核糖病毒域 Riboviria
界：	正核糖病毒界 Orthornavirae
門：	小核糖病毒門 Pisuviricota
綱：	小南嵌套病毒綱 Pisoniviricetes
目：	套式病毒目 Nidovirales
科：	冠狀病毒科 Coronaviridae
屬：	乙型冠狀病毒屬 Betacoronavirus
種：	黃鼠冠狀病毒HKU24 China Rattus Coronavirus HKU24

中國鼠冠狀病毒HKU24（China Rattus Coronavirus HKU24、ChRCoVHKU24）是乙型冠狀病毒屬的一種病毒，在香港與廣州的大鼠腸道中被發現，於2015年由香港大學的研究人員發表^[1]。

基因組

中國鼠冠狀病毒HKU24的基因組約長31200nt，編碼冠狀病毒皆有的複製酶（1a/1b）和刺突蛋白（S）、膜蛋白（M）、外膜蛋白（E）與衣殼蛋白（N）等四種結構蛋白，另外還有血細胞凝集素酯酶（英語：Hemagglutinin esterase）（HE）以及NS2a、NS4、NS5與N2等四種輔助蛋白，其基因順序為1ab-NS2-HE-S-NS4-NS5-E-M-N2-N^[1]。

演化

序列分析顯示中國鼠冠狀病毒HKU24在乙型冠狀病毒1型（牛冠狀病毒、人類冠狀病毒OC43、豬凝血性腦脊髓炎病毒等）的基部形成一演化支，顯示此病毒可能是乙型冠狀病毒1型（包含兔冠狀病毒HKU14）的姊妹群，和同亞屬中亦感染鼠類的鼠冠狀病毒則關係較遠。此病毒的演化地位顯示可感染多種動物的乙型冠狀病毒1型最早可能是由鼠類病毒演化而來。此病毒與乙型冠狀病毒1型、鼠冠狀病毒、人類冠狀病毒HKU1等共同組成一演化支支序A（lineage A），此演化支的病毒基因組中皆編碼血細胞凝集素酯酶（HE），其他冠狀病毒則無^[1]^[2]。

參見

參考文獻

^ ^1.0 ^1.1 ^1.2 Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y.; Li, Kenneth S. M.; Tsang, Alan K. L.; Fan, Rachel Y. Y.; Luk, Hayes K. H.; Cai, Jian-Piao; Chan, Kwok-Hung; Zheng, Bo-Jian. Sandri-Goldin, R. M. , 編. Discovery of a Novel Coronavirus, China Rattus Coronavirus HKU24, from Norway Rats Supports the Murine Origin of Betacoronavirus 1 and Has Implications for the Ancestor of Betacoronavirus Lineage A. Journal of Virology. 2015-03-15, 89 (6): 3076–3092 [2022-01-27]. ISSN 0022-538X. PMC 4337523 . PMID 25552712. doi:10.1128/JVI.02420-14. （原始內容存檔於2022-05-13）（英語）.
^ Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung. Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis. Viruses. 2010-08-24, 2 (8): 1804–1820 [2022-01-27]. ISSN 1999-4915. PMC 3185738 . PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. （原始內容存檔於2022-05-07）（英語）. In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).

[LauWoo2015-1] 1.0 ^1.1 ^1.2 Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y.; Li, Kenneth S. M.; Tsang, Alan K. L.; Fan, Rachel Y. Y.; Luk, Hayes K. H.; Cai, Jian-Piao; Chan, Kwok-Hung; Zheng, Bo-Jian. Sandri-Goldin, R. M. , 編. Discovery of a Novel Coronavirus, China Rattus Coronavirus HKU24, from Norway Rats Supports the Murine Origin of Betacoronavirus 1 and Has Implications for the Ancestor of Betacoronavirus Lineage A. Journal of Virology. 2015-03-15, 89 (6): 3076–3092 [2022-01-27]. ISSN 0022-538X. PMC 4337523 . PMID 25552712. doi:10.1128/JVI.02420-14. （原始內容存檔於2022-05-13）（英語）.

[:0-2] Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung. Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis. Viruses. 2010-08-24, 2 (8): 1804–1820 [2022-01-27]. ISSN 1999-4915. PMC 3185738 . PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. （原始內容存檔於2022-05-07）（英語）. In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).

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