黄鼠冠状病毒HKU24

黄鼠冠状病毒HKU24
病毒分类
（未分级）：	病毒 Virus
域：	核糖病毒域 Riboviria
界：	正核糖病毒界 Orthornavirae
门：	小核糖病毒门 Pisuviricota
纲：	小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目：	套式病毒目 Nidovirales
科：	冠状病毒科 Coronaviridae
属：	乙型冠状病毒属 Betacoronavirus
种：	黄鼠冠状病毒HKU24 China Rattus Coronavirus HKU24

中国鼠冠状病毒HKU24（China Rattus Coronavirus HKU24、ChRCoVHKU24）是乙型冠状病毒属的一种病毒，在香港与广州的大鼠肠道中被发现，于2015年由香港大学的研究人员发表^[1]。

基因组

中国鼠冠状病毒HKU24的基因组约长31200nt，编码冠状病毒皆有的复制酶（1a/1b）和刺突蛋白（S）、膜蛋白（M）、外膜蛋白（E）与衣壳蛋白（N）等四种结构蛋白，另外还有血细胞凝集素酯酶（英语：Hemagglutinin esterase）（HE）以及NS2a、NS4、NS5与N2等四种辅助蛋白，其基因顺序为1ab-NS2-HE-S-NS4-NS5-E-M-N2-N^[1]。

演化

序列分析显示中国鼠冠状病毒HKU24在乙型冠状病毒1型（牛冠状病毒、人类冠状病毒OC43、猪凝血性脑脊髓炎病毒等）的基部形成一演化支，显示此病毒可能是乙型冠状病毒1型（包含兔冠状病毒HKU14）的姊妹群，和同亚属中亦感染鼠类的鼠冠状病毒则关系较远。此病毒的演化地位显示可感染多种动物的乙型冠状病毒1型最早可能是由鼠类病毒演化而来。此病毒与乙型冠状病毒1型、鼠冠状病毒、人类冠状病毒HKU1等共同组成一演化支支序A（lineage A），此演化支的病毒基因组中皆编码血细胞凝集素酯酶（HE），其他冠状病毒则无^[1]^[2]。

参见

参考文献

^ ^1.0 ^1.1 ^1.2 Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y.; Li, Kenneth S. M.; Tsang, Alan K. L.; Fan, Rachel Y. Y.; Luk, Hayes K. H.; Cai, Jian-Piao; Chan, Kwok-Hung; Zheng, Bo-Jian. Sandri-Goldin, R. M. , 编. Discovery of a Novel Coronavirus, China Rattus Coronavirus HKU24, from Norway Rats Supports the Murine Origin of Betacoronavirus 1 and Has Implications for the Ancestor of Betacoronavirus Lineage A. Journal of Virology. 2015-03-15, 89 (6): 3076–3092 [2022-01-27]. ISSN 0022-538X. PMC 4337523 . PMID 25552712. doi:10.1128/JVI.02420-14. （原始内容存档于2022-05-13）（英语）.
^ Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung. Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis. Viruses. 2010-08-24, 2 (8): 1804–1820 [2022-01-27]. ISSN 1999-4915. PMC 3185738 . PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. （原始内容存档于2022-05-07）（英语）. In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).

[LauWoo2015-1] 1.0 ^1.1 ^1.2 Lau, Susanna K. P.; Woo, Patrick C. Y.; Li, Kenneth S. M.; Tsang, Alan K. L.; Fan, Rachel Y. Y.; Luk, Hayes K. H.; Cai, Jian-Piao; Chan, Kwok-Hung; Zheng, Bo-Jian. Sandri-Goldin, R. M. , 编. Discovery of a Novel Coronavirus, China Rattus Coronavirus HKU24, from Norway Rats Supports the Murine Origin of Betacoronavirus 1 and Has Implications for the Ancestor of Betacoronavirus Lineage A. Journal of Virology. 2015-03-15, 89 (6): 3076–3092 [2022-01-27]. ISSN 0022-538X. PMC 4337523 . PMID 25552712. doi:10.1128/JVI.02420-14. （原始内容存档于2022-05-13）（英语）.

[:0-2] Woo, Patrick C. Y.; Huang, Yi; Lau, Susanna K. P.; Yuen, Kwok-Yung. Coronavirus Genomics and Bioinformatics Analysis. Viruses. 2010-08-24, 2 (8): 1804–1820 [2022-01-27]. ISSN 1999-4915. PMC 3185738 . PMID 21994708. doi:10.3390/v2081803. （原始内容存档于2022-05-07）（英语）. In all members of Betacoronavirus subgroup A, a haemagglutinin esterase (HE) gene, which encodes a glycoprotein with neuraminate O-acetyl-esterase activity and the active site FGDS, is present downstream to ORF1ab and upstream to S gene (Figure 1).

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