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人类冠状病毒229E

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人类冠状病毒229E
病毒分类 编辑
（未分级）： 病毒 Virus
域： 核糖病毒域 Riboviria
界： 正核糖病毒界 Orthornavirae
门： 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲： 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目： 套式病毒目 Nidovirales
科： 冠状病毒科 Coronaviridae
属： 甲型冠状病毒属 Alphacoronavirus
种：
人类冠状病毒229E Human coronavirus 229E

人类冠状病毒229E（Human coronavirus 229E、HCoV-229E）是甲型冠状病毒属的一种病毒，于1966年被发现[1]，是已知七种能感染人类的冠状病毒中第一个被发现者[2]。229E病毒与同属的人类冠状病毒NL63以及乙型冠状病毒属的人类冠状病毒OC43和人类冠状病毒HKU1同为能感染人类上呼吸道、造成普通感冒的四种冠状病毒[3]。此病毒以丙氨酸氨肽酶（AP-N）为受体感染人类细胞[4]。蝙蝠、羊驼与单峰骆驼体内均有发现与此病毒高度相似的病毒。

发现

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1965年，英国研究人员发表了一新种感冒病毒，称其为B814株系[5]，是最早发现感染人类的冠状病毒，但此株系已佚失，不清楚其是否与现在已知的冠状病毒有关[6]。1966年又有研究人员从呼吸道感染的病人样本中分离了一病毒，将其命名为229E，其外型与B814非常相似。随后又有多种相似的株系被相继发表[7][8]。

基因组

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人类冠状病毒229E为正单链RNA病毒，具有外膜，其基因组长约27000nt[9]。除冠状病毒皆有的复制酶（1a/1b）和刺突蛋白（S）、膜蛋白（M）、外膜蛋白（E）与衣壳蛋白（N）等四种结构蛋白外，此病毒在刺突蛋白与外膜蛋白的基因之间尚有一开放阅读框ORF4，过去认为其分为两个开放阅读框ORF4a与ORF4b，但2006年有研究指出临床的229E病毒检体含有一个完整的ORF4，编码一由219个氨基酸组成的辅助蛋白，且与人类冠状病毒NL63和猪流行性腹泻病毒（PEDV）的ORF3（亦位于刺突蛋白与外膜蛋白的基因之间）同源，原本分为ORF4a和4b的基因组是实验室病毒株发生的突变[10]。

演化

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2007年，有一新型冠状病毒从美国圈养的羊驼体内被分离，即羊驼冠状病毒（Alpaca Coronavirus、ACoV），其序列与229E病毒的相似度高达92.2%[11]，并可能曾与229E病毒发生重组[12]。2009年有研究显示人类冠状病毒229E可能是从非洲的蹄蝠属蝙蝠中的冠状病毒演化而来，两者可能在距今约200多年前由共同祖先分支[13]。2015年蹄蝠属蝙蝠中又有许多和229E亲缘关系接近的病毒被发现，与人类229E病毒和羊驼冠状病毒相较之下，这些蝙蝠病毒的刺突蛋白序列较长，其中与人类229E病毒关系较接近者，多出的序列长度亦较短；此外这些蝙蝠病毒与羊驼冠状病毒在衣壳蛋白基因的下游尚有一编码辅助蛋白的开放阅读框ORF8（在羊驼病毒中或称为ORFX），人类229E病毒虽无此开放阅读框，但此区的序列与其相似，可能是演化过程中丢失了此一开放阅读框[12]。

2016年，研究人员又在沙特阿拉伯与肯尼亚的单峰骆驼体内发现了一些与229E病毒关系接近的冠状病毒，这些病毒和229E病毒的关系可能比上述的蝙蝠病毒更接近，与229E病毒一样不具有蝙蝠病毒在刺突蛋白多余的序列，但大多具有ORF8，惟肯尼亚骆驼体内有病毒的ORF8也发生了部分序列缺失[14]。2017年肯尼亚的蹄蝠属蝙蝠采样中发现了BtKY229E-1、BtKY229E-8等与229E病毒关系接近的病毒，皆具有ORF8，通称229E样蝙蝠冠状病毒。这些研究显示人类229E病毒可能起源于蝙蝠中的类似病毒，但不一定是直接由蝙蝠传给人类，而可能是以骆驼等其他动物为中间宿主传播[15]。

感染

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人类冠状病毒229E感染人类的呼吸道，潜伏期为2–5天，通常只造成轻微的症状，包括身体不适、头痛、流鼻水与喉咙痛等，约有10%–20%的感染者会有发烧与咳嗽，与其他呼吸道病毒感染造成的症状相似[16]，但在免疫缺陷的病人中可能造成较严重的肺炎[17]。另外有研究指此病毒与川崎氏症有关[18]。

229E病毒可能与其他呼吸道病毒（包括人类冠状病毒OC43、甲型流感病毒、人类呼吸道合胞病毒与人类偏肺病毒）同时造成感染[19][20]。

参考文献

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  1. ^ Hamre, D.; Procknow, J. J. A New Virus Isolated from the Human Respiratory Tract.. Experimental Biology and Medicine. 1966, 121 (1): 190–193. ISSN 1535-3702. doi:10.3181/00379727-121-30734. 
  2. ^ Amesh A. Adalja. Novel Coronavirus in UK and Saudi Arabia. Johns Hopkins Center for Health Security（英语：Johns Hopkins Center for Health Security）. 2012-10-05 [2020-03-25]. （原始内容存档于2020-11-14）. 
  3. ^ Human Coronavirus Types. Centers for Disease Control and Prevention. 2020-02-15 [2020-03-25]. （原始内容存档于2020-02-04）. 
  4. ^ Yeager, Curtis L.; Ashmun, Richard A.; Williams, Richard K.; Cardellichio, Christine B.; Shapiro, Linda H.; Look, A. Thomas; Holmes, Kathryn V. Human aminopeptidase N is a receptor for human coronavirus 229E. Nature. 1992, 357 (6377): 420–422. ISSN 0028-0836. doi:10.1038/357420a0. 
  5. ^ Tyrrell, D. A. J.; Bynoe, M. L. Cultivation of a Novel Type of Common-cold Virus in Organ Cultures. BMJ. 1965, 1 (5448): 1467–1470. ISSN 0959-8138. doi:10.1136/bmj.1.5448.1467. 
  6. ^ van der Hoek, Lia; Pyrc, Krzysztof; Berkhout, Ben. Human coronavirus NL63, a new respiratory virus. FEMS Microbiology Reviews. 2006, 30 (5): 760–773. ISSN 1574-6976. doi:10.1111/j.1574-6976.2006.00032.x. 
  7. ^ Cavallaro, J. J.; Monto, A. S. Community-wide Outbreak of Infection with a 229E-like Coronavirus in Tecumseh, Michigan. Journal of Infectious Diseases. 1970, 122 (4): 272–279. ISSN 0022-1899. doi:10.1093/infdis/122.4.272. 
  8. ^ Berry, Michael; Gamieldien, Junaid; Fielding, Burtram. Identification of New Respiratory Viruses in the New Millennium. Viruses. 2015, 7 (3): 996–1019. ISSN 1999-4915. doi:10.3390/v7030996. 
  9. ^ Human coronavirus 229E. NCBI. [2020-03-26]. （原始内容存档于2020-06-08）. 
  10. ^ Dijkman, Ronald; Jebbink, Maarten F; Wilbrink, Berry; Pyrc, Krzysztof; Zaaijer, Hans L; Minor, Philip D; Franklin, Sally; Berkhout, Ben; Thiel, Volker; van der Hoek, Lia. Human coronavirus 229E encodes a single ORF4 protein between the spike and the envelope genes. Virology Journal. 2006, 3 (1): 106. ISSN 1743-422X. doi:10.1186/1743-422X-3-106. 
  11. ^ Crossley, Beate; Mock, Richard; Callison, Scott; Hietala, Sharon. Identification and Characterization of a Novel Alpaca Respiratory Coronavirus Most Closely Related to the Human Coronavirus 229E. Viruses. 2012, 4 (12): 3689–3700. ISSN 1999-4915. doi:10.3390/v4123689. 
  12. ^ 12.0 12.1 Corman, Victor Max; Baldwin, Heather J.; Tateno, Adriana Fumie; Zerbinati, Rodrigo Melim; Annan, Augustina; Owusu, Michael; Nkrumah, Evans Ewald; Maganga, Gael Darren; Oppong, Samuel; Adu-Sarkodie, Yaw; Vallo, Peter; da Silva Filho, Luiz Vicente Ribeiro Ferreira; Leroy, Eric M.; Thiel, Volker; van der Hoek, Lia; Poon, Leo L. M.; Tschapka, Marco; Drosten, Christian; Drexler, Jan Felix; Schultz-Cherry, S. Evidence for an Ancestral Association of Human Coronavirus 229E with Bats. Journal of Virology. 2015, 89 (23): 11858–11870. ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01755-15. 
  13. ^ Pfefferle, Susanne; Oppong, Samuel; Drexler, Jan Felix; Gloza-Rausch, Florian; Ipsen, Anne; Seebens, Antje; Müller, Marcel A.; Annan, Augustina; Vallo, Peter; Adu-Sarkodie, Yaw; Kruppa, Thomas F.; Drosten, Christian. Distant Relatives of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus and Close Relatives of Human Coronavirus 229E in Bats, Ghana. Emerging Infectious Diseases. 2009, 15 (9): 1377–1384. ISSN 1080-6040. doi:10.3201/eid1509.090224. 
  14. ^ Corman, Victor M.; Eckerle, Isabella; Memish, Ziad A.; Liljander, Anne M.; Dijkman, Ronald; Jonsdottir, Hulda; Juma Ngeiywa, Kisi J. Z.; Kamau, Esther; Younan, Mario; Al Masri, Malakita; Assiri, Abdullah; Gluecks, Ilona; Musa, Bakri E.; Meyer, Benjamin; Müller, Marcel A.; Hilali, Mosaad; Bornstein, Set; Wernery, Ulrich; Thiel, Volker; Jores, Joerg; Drexler, Jan Felix; Drosten, Christian. Link of a ubiquitous human coronavirus to dromedary camels. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2016, 113 (35): 9864–9869. ISSN 0027-8424. doi:10.1073/pnas.1604472113. 
  15. ^ Tao, Ying; Shi, Mang; Chommanard, Christina; Queen, Krista; Zhang, Jing; Markotter, Wanda; Kuzmin, Ivan V.; Holmes, Edward C.; Tong, Suxiang; Perlman, Stanley. Surveillance of Bat Coronaviruses in Kenya Identifies Relatives of Human Coronaviruses NL63 and 229E and Their Recombination History. Journal of Virology. 2017, 91 (5). ISSN 0022-538X. doi:10.1128/JVI.01953-16. 
  16. ^ Su, Shuo; Wong, Gary; Shi, Weifeng; Liu, Jun; Lai, Alexander C.K.; Zhou, Jiyong; Liu, Wenjun; Bi, Yuhai; Gao, George F. Epidemiology, Genetic Recombination, and Pathogenesis of Coronaviruses. Trends in Microbiology. 2016, 24 (6): 490–502. ISSN 0966-842X. doi:10.1016/j.tim.2016.03.003. 
  17. ^ Warnes, Sarah L.; Little, Zoë R.; Keevil, C. William; Colwell, Rita. Human Coronavirus 229E Remains Infectious on Common Touch Surface Materials. mBio. 2015, 6 (6). ISSN 2150-7511. doi:10.1128/mBio.01697-15. 
  18. ^ Shirato, Kazuya; Imada, Yoshio; Kawase, Miyuki; Nakagaki, Keiko; Matsuyama, Shutoku; Taguchi, Fumihiro. Possible involvement of infection with human coronavirus 229E, but not NL63, in Kawasaki disease. Journal of Medical Virology. 2014, 86 (12): 2146–2153. ISSN 0146-6615. doi:10.1002/jmv.23950. 
  19. ^ Walsh, E. E.; Shin, J. H.; Falsey, A. R. Clinical Impact of Human Coronaviruses 229E and OC43 Infection in Diverse Adult Populations. Journal of Infectious Diseases. 2013, 208 (10): 1634–1642. ISSN 0022-1899. doi:10.1093/infdis/jit393. 
  20. ^ Gaunt, E. R.; Hardie, A.; Claas, E. C. J.; Simmonds, P.; Templeton, K. E. Epidemiology and Clinical Presentations of the Four Human Coronaviruses 229E, HKU1, NL63, and OC43 Detected over 3 Years Using a Novel Multiplex Real-Time PCR Method. Journal of Clinical Microbiology. 2010, 48 (8): 2940–2947. ISSN 0095-1137. doi:10.1128/JCM.00636-10. 

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