司马文深（4世纪—401年），东晋宗室，司马承的玄孙，司马无忌的曾孙，司马恬之孙，司马恢之的儿子。
高阳王司马毅在永嘉之乱时被杀。直到东晋末年，隆安元年（397年），晋安帝以谯敬王司马恬次子司马恢之子司马文深出继司马毅，袭封高阳王（治所在今河北省蠡县南十五里）。在位五年，隆安五年（401年）去世，无嗣，再以高密王司马纯之之子、司马文深的族侄司马法莲出继司马文深，袭封高阳王。
