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凝胶电泳（英语：Gel electrophoresis）或称胶体电泳，也可称为扁平式电泳法（slab electrophoresis），是一大类技术，被科学工作者用于分离不同物理性质（如大小、形状、等电点等）的分子。凝胶电泳通常用于分析用途，但也可以作为制备技术，在采用某些方法，如质谱、聚合酶链式反应、克隆、DNA测序或者免疫印迹检测之前，进行部分提纯分子。

第一个部分，“凝胶”，是指用来分离分子的基质（matrix）。大致上凝胶是个可以被科学家控制多孔性（porosity）的交联聚合物。在分离蛋白质或小的核酸（DNA、RNA，或寡核苷酸）的时候，凝胶通常是用不同浓度的丙烯酰胺和一个交联剂聚合而成，形成不同大小网眼的聚丙烯酰胺网状系统。

分离较大的核酸（超过几百个碱基对时）较常用的基质是纯化的洋菜胶，洋菜胶是海藻（seaweed）的萃取物。

在以上两者里的凝胶都是形成固体但是具孔隙的基质，外观和触感都像透明的果冻。丙烯酰胺，相对于聚丙烯酰胺，是种神经毒素，而且需要用良好药品实验研究规范（Good Laboratory Practices，GLP）处理以避免毒性。