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严重急性呼吸窘迫综合征相关病毒

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严重急性呼吸综合征相关冠状病毒
病毒分类 编辑
(未分级) 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 正核糖病毒界 Orthornavirae
门: 小核糖病毒门 Pisuviricota
纲: 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes
目: 套式病毒目 Nidovirales
科: 冠状病毒科 Coronaviridae
属: 乙型冠状病毒属 Betacoronavirus
亚属: SARS乙型冠状病毒亚属 Sarbecovirus
种:
严重急性呼吸综合征相关冠状病毒 Severe acute respiratory
syndrome-related coronavirus
病毒株
“SARS-CoV”的各地常用译名
中国大陆严重急性呼吸窘迫综合征相关病毒[1]
台湾严重急性呼吸道症候群相关冠状病毒
港澳严重急性呼吸系统综合症相关冠状病毒

严重急性呼吸窘迫综合征相关病毒(英语:Severe acute respiratory syndrome–related coronavirus),简称SARS相关冠状病毒SARSr-CoV),是冠状病毒科乙型冠状病毒属的一个[2]该种病毒现有2个可传染人的分型[3]

分型

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  • 第二个分型称为严重急性呼吸综合征冠状病毒2(英语:Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,简称SARS-CoV-2),发现于2019年,引发了2019冠状病毒疾病的疫情[3],有研究认为,该病毒类型可能是通过马来穿山甲传播给人类的[5][6]。截至2021年6月,病毒溯源工作仍在进行[7]。统计至2021年2月4日为止,病例数约为SARS-CoV的12800倍,病逝人数约为2900倍。
关系图
 
 
 
 
 
 
严重急性呼吸综合征相关冠状病毒
SARSr-CoV
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
严重急性呼吸综合征冠状病毒1型
SARS-CoV-1
 
 
 
 
 
严重急性呼吸综合征冠状病毒2
SARS-CoV-2

演化树

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截至2021年1月 (2021-01)SARS-CoV与相关病毒株的系统发生树

16BO133 与SARS-COV相似度82.8 % · 马铁菊头蝠 · 韩国全罗北道 (2016年采集、2019年发表)[8]

Rf1 87.8 % · 马铁菊头蝠 · 中国湖北宜昌 (2004年采集、2005年发表)[9]

BtCoV HKU3 87.9 % · 中华菊头蝠 · 香港、中国广东 (2004年采集、2005年发表、2010年又发表若干新病毒株)[10]

LYRa11 90.9 % · 中菊头蝠 · 中国云南保山 (2011年采集、2014年发表)[11]

Rp3 92.6 % · 皮氏菊头蝠 · 中国广西南宁 (2004年采集、2005年发表)[9]

SL-CoV YNLF_31C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中国云南禄丰 (2013年采集、2015年发表)[12]

SL-CoV YNLF_34C 93.5 % · 马铁菊头蝠 · 中国云南禄丰 (2013年采集、2015年发表)[12]

SHC014 95.4 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明 (2011年采集、2013年发表)[13]

WIV1 95.6 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明 (2012年采集、2013年发表)[13]

WIV16 96.0 % · 中华菊头蝠 · 中国云南昆明 (2013年采集、2016年发表)[14]

果子狸SARS冠状病毒 99.8 % · 果子狸 · 中国广东[10]

SARS-CoV 100 %

SARS-CoV-2 79 %

  蝙蝠病毒
  果子狸病毒
  人类病毒


SARS-CoV-2与相关病毒株的系统发生树[15][16] :

Rc-o319 与SARS-CoV-2相似度81 % · 角菊头蝠 · 日本岩手县 (2013年采集、2020年发表)[17]

SL-ZXC21 88 % · 小菊头蝠 · 中华人民共和国浙江舟山(2015年采集、2018年发表)[18]

SL-ZC45 88 % · 小菊头蝠 · 中华人民共和国浙江舟山(2017年采集、2018年发表)[18]

Pangolin-CoV-GX 85.5 % · 马来穿山甲 · 东南亚 (2017年采集、2020年发表)[19]

Pangolin-CoV-GD 90.1 % · 马来穿山甲 · 东南亚 (2019年采集、2020年发表)[20]

RshSTT182 92.6 % · 扁颅菊头蝠英语Rhinolophus shameli · 柬埔寨上丁省 (2010年采集、2021年发表)[16]

RshSTT200 92.6 % · 扁颅菊头蝠 · 柬埔寨上丁省 (2010年采集、2021年发表)[16]

RacCS203英语RacCS203 91.5 % · 大角菊头蝠英语Rhinolophus acuminatus · 泰国差春骚府 (2020年采集、2021年发表)[15]

RmYN02 93.3 % · 马来亚菊头蝠 · 中华人民共和国云南勐腊 (2019年采集、2020年发表)[21]

RaTG13 96.2 % · 中菊头蝠 · 中华人民共和国云南墨江 (2013年采集、2020年发表)[22]

BANAL-52 96.8 % · 马来亚菊头蝠 · 老挝永珍省 (2020年采集、2022年发表)[23]

SARS-CoV-2 100 %

SARS-CoV 79%

  蝙蝠病毒
  穿山甲病毒
  人类病毒

参考文献

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引用

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  1. ^ Zhang Zhongxin (张忠信), et al, 2023. Betacoronavirus Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus页面存档备份,存于互联网档案馆) in Catalogue of Life China: 2023 Annual Checklist (中国生物物种名录:2023版), Beijing, China.
  2. ^ Thiel V (editor). Coronaviruses: Molecular and Cellular Biology 1st. Caister Academic Press. 2007. ISBN 978-1-904455-16-5. 
  3. ^ 3.0 3.1 3.2 Gorbalenya, Alexander E.; Baker, Susan C.; Baric, Ralph S.; de Groot, Raoul J.; Drosten, Christian; Gulyaeva, Anastasia A.; Haagmans, Bart L.; Lauber, Chris; Leontovich, Andrey M. The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus : classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2. Nature Microbiology. 2020-04, 5 (4): 536–544 [2020-03-03]. ISSN 2058-5276. doi:10.1038/s41564-020-0695-z. (原始内容存档于2020-03-05) (英语). 
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  7. ^ 新冠溯源:世卫要求复查意大利早期样本. 德国之声. 2021-06-02 [2021-06-11]. (原始内容存档于2021-06-11). 
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来源

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外部链接

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参见

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